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從細胞膜內調低發炎訊號:設計蛋白瞄準TLR4跨膜區域

一段埋在細胞膜中的受體結構,可能提供新的抗發炎切入點。研究團隊以電腦設計合成蛋白,在人類細胞中降低TLR4下游訊號;但如何送達目標,以及能否改善疾病,仍是走向治療前的關鍵考驗。

By SURL BioNews

免疫受體接收到外界訊息後,如何穿過細胞膜,把警報傳進細胞?這段過程也可能藏著抑制發炎的新機會。Scripps Research團隊設計出合成蛋白,瞄準先天免疫受體TLR4埋在膜內的區域,在實驗室培養的人類細胞中降低發炎相關訊號,為一處難以設計藥物作用的部位提供了實驗證據。

這項研究於9月22日發表於《美國國家科學院院刊》(PNAS)。TLR4參與辨識細菌並啟動免疫反應,但其過度活化也與多種發炎疾病有關。研究聚焦的跨膜區域,除了把受體固定在膜上,還可能透過蛋白彼此接觸的角度與排列,決定訊息如何向細胞內傳遞。

團隊先以包含TLR4跨膜區域及鄰近部分的天然蛋白片段測試這個想法。利用標記蛋白靠近時會發光的篩選方法,研究人員觀察到片段與TLR4接近、產生交互作用的證據,同時測得下游NF-κB訊號下降。NF-κB是調控發炎反應的重要訊號途徑;這些結果支持從膜內干預受體功能的可行性,也驗證了篩選平台的用途。

接下來的難題,是設計能在脂質膜中與TLR4穩定接合的蛋白。細胞膜的環境不同於細胞內外的水相,現有結構預測與AI模型未必能準確描述其中的交互作用。團隊因此把電腦產生的三維結構當作起點,再以自訂準則優化「非極性堆積」,讓合成蛋白與受體接觸面的化學結構更緊密貼合,最後挑出九個候選進入細胞測試。

依Scripps的研究說明,九個候選中有八個呈現與TLR4結合的跡象,其中Design-6的交互作用證據最強,並能明顯降低NF-κB訊號。它也比天然TLR4跨膜片段較不容易聚集。不過,八個候選出現交互作用跡象,不代表八個都具有相同的抑制效果;較少聚集也不能直接推定為較安全或更適合用藥。

目前的驗證使用人類胚胎腎細胞,尚不能回答這種策略在疾病中的實際效果。研究團隊指出,後續須在與發炎更相關的免疫細胞或肝細胞中確認結果,並解決如何把這些疏水性合成蛋白送入目標細胞膜的問題。患者療效尚未經過測試,細胞訊號下降與臨床症狀改善之間,仍有一段需要實驗填補的距離。

這項工作的直接價值,是讓研究人員有工具探查TLR4跨膜區域如何控制訊號,也為膜內蛋白的設計建立可檢驗的方法。三名作者已揭露與研究相關的美國臨時專利申請。能否進一步成為抗發炎療法,則取決於後續疾病模型、遞送方式與安全性驗證,不能僅由這次細胞實驗判定。

References

  1. Scripps Research
  2. PubMed / Proceedings of the National Academy of Sciences
  3. Phys.org (provided by Scripps Research Institute)