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噬菌體揭開細菌細胞壁的脆弱開關

抗藥性細菌讓舊有抗生素愈來愈吃力;一項結構生物學研究顯示,多種彼此無關的病毒竟以相近方式鎖死 MurJ 蛋白,為尋找新型抗菌標靶提供了清晰線索,但距離藥物仍有一段實驗路要走。

By SURL BioNews

抗藥性細菌的威脅,常被描述成藥物研發與微生物演化之間的追逐。新的線索來自一個意外的老師:專門感染細菌的噬菌體。根據加州理工學院團隊發表於《Nature》的研究,幾種彼此沒有明顯親緣關係的病毒蛋白,都能把細菌建造細胞壁所需的 MurJ 蛋白卡在同一種構形,讓細胞壁工程停擺,最後導向細菌死亡。

MurJ 是細菌內膜上的「翻轉酶」,負責把肽聚醣前驅物從細胞內側送到外側,使它們能被接上正在延伸的細胞壁。肽聚醣是許多細菌維持形狀與抵抗滲透壓的關鍵材料,人類細胞並不具有這種結構,因此長期以來是抗生素研發的重要方向。青黴素與相關藥物已經證明,干擾細胞壁建造可以有效殺菌;這項研究則把視線移向更早、更內側的運輸步驟。

團隊聚焦的是小型噬菌體用來裂解宿主的單基因裂解蛋白,英文縮寫為 Sgl。研究人員以冷凍電子顯微鏡解析 MurJ 與不同 Sgl 結合時的高解析結構,發現 SglM、SglPP7 以及新辨識出的 SglCJ3 都會嵌入 MurJ 的溝槽,使這個蛋白停留在朝外開放的狀態。對一個必須在內外兩側之間轉換構形的運輸蛋白而言,這等於按下機械煞車。

真正使這項發現具有分量的,不只是「找到一個會被病毒攻擊的蛋白」,而是不同病毒似乎分別演化出相似策略。這種趨同演化暗示,MurJ 可能是細菌生理中少數既關鍵又可被精準干預的位置。若自然界的噬菌體反覆選中同一個弱點,藥物開發者便有理由仔細研究它是否能被小分子或其他治療設計模仿。

不過,這仍主要是基礎研究與結構生物學的成果,不是新抗生素已經問世。公開資訊顯示,研究證明了噬菌體蛋白如何抑制 MurJ,並提供可能的設計藍圖;但要把蛋白質與目標結合的構形,轉化為可進入人體、可穩定抵達感染部位、且不易迅速誘發抗性的藥物,還需要化合物篩選、活性測試、毒性評估與動物或臨床研究。

這項發現也提醒人們,抗藥性問題未必只能靠改造既有藥物應對。噬菌體與細菌長期交手,早已在自然界中試過許多殺菌策略;把這些策略拆解到原子尺度,可能會替抗生素研發指出新的入口。它能否改變超級細菌治療格局,現在還不能下結論;但 MurJ 這個被病毒反覆鎖定的細胞壁開關,已經成為值得投入下一輪實驗的清楚候選標靶。

References

  1. ScienceDaily Genetics