Investigación sobre el cáncer · us
Leer la actividad tumoral en la orina: una prueba de ARN para el cáncer de vejiga también explora la respuesta al tratamiento
uRARE-seq mostró una alta sensibilidad de detección en un estudio y busca pistas para seleccionar tratamientos a partir de señales inmunitarias y de proliferación en la orina; su capacidad para reducir la carga de las pruebas repetidas y mejorar los resultados del tratamiento aún requiere validación prospectiva.
Para los pacientes con cáncer de vejiga, extirpar el tumor suele ser solo el comienzo de un largo seguimiento. El cáncer tiende a reaparecer, y someterse repetidamente a cistoscopias también supone una carga. Ahora, un equipo de Stanford intenta responder preguntas más detalladas a partir de una muestra de orina: si el tumor sigue presente y si su actividad biológica puede ofrecer pistas sobre el siguiente paso del tratamiento.
Un estudio publicado el 2 de octubre en *Nature Medicine* evaluó un método de secuenciación de ARN libre en orina denominado uRARE-seq y analizó un total de 683 muestras de orina aportadas por 515 participantes. La investigación fue realizada conjuntamente por equipos de Stanford y del Sistema de Atención Sanitaria de Palo Alto del Departamento de Asuntos de los Veteranos de Estados Unidos, entre otros, con la participación de Resero Bio. El ARN refleja la actividad que están realizando los genes, por lo que, además de buscar señales de cáncer, también podría describir el estado del tumor y de la respuesta inmunitaria que lo rodea.
Sin embargo, el ARN presente en la orina es escaso y está muy fragmentado. Según las descripciones de Stanford y LabMedica, el equipo adaptó una técnica de secuenciación utilizada originalmente para el ARN del plasma y diseñó un panel de captura específico, centrado en analizar transcritos poco frecuentes en la orina de personas sanas, pero más abundantes en los tumores del sistema genitourinario. Después, utilizó un modelo de aprendizaje automático para identificar señales de cáncer de vejiga.
En el conjunto de entrenamiento de 251 muestras, el modelo de detección del cáncer de vejiga localizado alcanzó una sensibilidad del 95% con una especificidad del 90%; esto también significa que, en las condiciones del estudio, aproximadamente una de cada diez muestras sin cáncer podría clasificarse como positiva. Una vez fijado el modelo, se realizó una validación independiente con 142 muestras de cáncer de vejiga y 140 controles sin cáncer, con un rendimiento similar. Además, entre 93 muestras de cáncer evaluadas mediante ambas pruebas, uRARE-seq detectó 89, mientras que la citología urinaria detectó 32; esta comparación respalda su potencial de detección, pero todavía no permite concluir que pueda sustituir a la cistoscopia.
Otra línea de investigación de la prueba consiste en seguir las señales de enfermedad que persisten después del tratamiento. El estudio analizó la orina antes y después de la cirugía y de la inmunoterapia intravesical con bacilo de Calmette-Guérin (BCG), y encontró una asociación entre la persistencia del ARN tumoral y un mayor riesgo de recurrencia. El BCG estimula la respuesta inmunitaria para eliminar las células cancerosas; identificar qué pacientes siguen teniendo enfermedad residual a nivel molecular después de la cirugía podría aportar una base para el seguimiento posterior y la investigación de tratamientos.
La orina previa al tratamiento también mostró diferencias: quienes posteriormente respondieron al BCG presentaban una mayor abundancia de señales de células T e inmunitarias, mientras que quienes no respondieron tenían señales más intensas de proliferación celular. El equipo utilizó muestras previas al tratamiento de 114 pacientes para desarrollar biomarcadores que predijeran la respuesta al BCG y a la quimioterapia, con un área bajo la curva (AUC) de 0.93. Este valor es un indicador de la capacidad de discriminación del modelo y no equivale a que se pueda seleccionar correctamente el fármaco para el 93% de los pacientes; tampoco demuestra que modificar el tratamiento basándose en él mejore el pronóstico.
Para pasar de herramienta de investigación a la consulta clínica, sigue siendo fundamental una validación más cercana a la práctica asistencial. Este estudio empleó un diseño de casos y controles, con muestras procedentes de dos instituciones vinculadas entre sí y geográficamente próximas; tampoco hubo una asignación aleatoria a los grupos de tratamiento, por lo que los resultados podrían verse afectados por factores no medidos. El equipo planea estudios prospectivos de mayor tamaño y multicéntricos para confirmar el rendimiento de la prueba y sus beneficios clínicos. Stanford también informó de que algunos autores tienen participaciones en Resero Bio, que impulsa la comercialización de la tecnología, y están vinculados a patentes relacionadas; una validación independiente posterior también ayudaría a evaluar si los resultados son ampliamente aplicables.